使用 HMMER 查找同源基因比 blast 更加准确，速度也更快，但使用方法很少有文章讲清楚，本文记录我使用 HMMER 的操作。 HMMER HMMER 是基于隐马尔可夫模型，用于生物序列分析工作的一个非常强大的软件包，它的一般用途是识别同源蛋白或核苷酸序列和进行序列比对。与 BLAST、FASTA 等序列比对和数据库搜索工具相比，HMMER 更准确 从功能基因研究的角度来讲，相关的搜索，比如...