这是一批多组织单细胞数据的整合流程，34 个文库、8 个组织、约 19 万个细胞，从逐个文库的表达矩阵做到批次校正之后的统一聚类。流程里最容易出问题的往往不是分析本身，而是去双细胞和批次校正这两步的先后顺序和阈值，错了不报错，只是细胞悄悄变少，或者聚类结果跟着文库走。 同一物种做多个组织、分多批建库的单细胞测序时，文库之间叠着建库批次、测序质量和组织本身的转录组差异。如果每个文库单独聚类，同一类细...