这套分析用 DAP-seq 实测的转录因子结合位点当物理证据，用单细胞共表达当表达证据，两层取交集建调控网络，也就是 mGRN+。表达层用的是上游整合流程产出的 harmony 注释对象，脚本按运行顺序列在下面，最后一节写这套做法与已有的大规模 DAP-seq 建网络研究的差异。 基因调控网络最怕两件事。只靠表达相关性连边，会把连带变化当成直接调控。只靠结合位点连边，会把能结合当成在调控。所以这里...