维燕的数字花园： Python 包 matplotlib 安装的一些问题
Python 的 matplotlib 在安装的过程中一直无法解决 freetype2 自动下载的问题，导致始终安装不成功。 Python-3.10.16 通过本地（或者是在线）方式安装 matplo...
维燕的数字花园： GitHub Actions 更新 Submodule
怎么通过 GitHub Actions 实时更新 Git 仓库中的子模块（submodules）。 name: Send submodule updates to parent repo on: pu...
维燕的数字花园： hisat2-build RAM 不足
在 96G RAM 的节点跑 T2T-CHM13v2.0 的 HISAT2 index 时候，发现任务居然被系统 Killed 掉了。 排查一下才发现是因为 RAM 内存不够！ Note: If yo...
维燕的数字花园： Galaxy 平台 release_24.x 升级之路
2024-10-182025-10-26 记录一下 Galaxy 分析平台从 release_20.09 升级到 release_24.0，横跨九个发布版本的升级之路。 为什么要升级¶ 很主...
维燕的数字花园： GCC 版本不一致导致的 R magick 包安装错误
在安装 Y 叔的 yyplot 时候，发现 magick 依赖包安装的时候的一些棘手问题，特此记录一下。 R-4.0.3 安装¶ > library(remotes) > remotes...
维燕的数字花园： Linux 下 PostgreSQL 源码编译安装
PostgreSQL 是一个功能强大的开源对象关系数据库管理系统(ORDBMS)，它从伯克利写的 POSTGRES 软件包发展而来（1995 年几个 UCB 的学生为 Post-Ingres 开发了 ...
维燕的数字花园： R 包安装指定 GCC 和 G++ 并开启 C++11 支持
如果你的 R 是使用比较低版本的 GCC（如 Red Hat 6.5 + GCC/G++ 4.4.7），但安装的 R 包需要开启 C++11 支持，或者需要更高版本的 GCC 和 G++，可以参考一下...
维燕的数字花园： Python 陷阱之 strip、lstrip、rstrip 可以删除比预期更多的内容
本文章内容来源于 《Python Gotcha: strip, lstrip, rstrip can remove more than expected》，由作者翻译，仅供个人学习使用，如有内容侵犯了...
维燕的数字花园： mamba 的两个分支 miniforge 和 mambaforge
在安装 mamba 的时候在 release 页面和官方的安装页面 总是看到关于 miniforge 和 mambaforge 的选择问题，傻傻搞不明白。 Miniforge 和 Mambaforge...
维燕的数字花园： Python 里面没 if 也能用 else
这是来自于 Yang Zhou 发表在 Medium 的一篇文章 《Beyond If-Else: Leveraging Python’s Versatile “Else” Statements》，作...